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Los científicos inventan una herramienta para ver qué tan "saludable" es su microbioma intestinal: ¿funciona?


Una nueva herramienta puede revelar si alguien tiene un microbioma intestinal "saludable" proporcionando una puntuación simple, pero quedan muchas preguntas.

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El microbioma intestinal, la comunidad de microorganismos que viven en el colon, puede determinar el riesgo de que una persona desarrolle enfermedades crónicas, como diabetes tipo 2 y enfermedades cardíacas. Ahora, los científicos han desarrollado una herramienta computacional que, según dicen, puede revelar qué tan "saludable" es el microbioma intestinal de una persona, utilizando datos de una sola muestra de heces.

Aunque el concepto es intrigante, los expertos dijeron a WordsSideKick.com que tienen reservas sobre cuán útil sería realmente la nueva herramienta para los pacientes.

La herramienta, llamada Índice de bienestar del microbioma intestinal 2 (GMWI2), otorga a los usuarios una puntuación entre -6 y +6. Cuanto mayor sea la puntuación, más "saludable" será su microbioma intestinal, y viceversa. En un estudio reciente, publicado el 28 de agosto en la revista Nature Communications, los investigadores encontraron que el GMWI2 tenía una precisión del 80 % para diferenciar entre un microbioma intestinal "saludable", en el extremo positivo del espectro, y uno "insalubre", en el extremo opuesto. La herramienta se entrenó con muestras de heces de 8.000 personas y luego se probó en muestras de 1.140 personas.

Cualquiera puede descargar y utilizar GMWI2 libremente, pero necesitará "una formación básica en informática o bioinformática" para interpretar los resultados, afirma el coautor del estudio Jaeyun Sung, un asistente. profesor de cirugía de la Clínica Mayo en Minnesota, dijo a WordsSideKick.com.

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El equipo espera que eventualmente cualquiera pueda obtener una puntuación de salud intestinal en su clínica local proporcionando una muestra de heces, dijo Sung. Sin embargo, otros expertos han expresado su preocupación sobre la posible utilidad de dicha herramienta. Se preguntan qué significa tener un microbioma intestinal "saludable" en este contexto y quién podría beneficiarse al conocer su puntuación de salud intestinal.

Definición de "saludable"

GMWI2 se basa en un tipo de aprendizaje automático, una herramienta de inteligencia artificial (IA) que puede hacer predicciones sobre un dato basándose en un conjunto de reglas para las que ha sido entrenado. Normalmente, los científicos "entrenan" la IA proporcionando grandes cantidades de datos de una población determinada, y luego, una vez que ha detectado patrones comunes en esos datos, la herramienta puede hacer predicciones sobre nuevos datos de un grupo diferente de personas.

En este caso, los investigadores entrenaron a GMWI2 para identificar características específicas de los microbiomas intestinales de personas que padecen una enfermedad (por ejemplo, diabetes) y compararlas con los microbiomas intestinales de personas sin esa afección. Lo hicieron alimentándolo con datos sobre la mezcla de microbios encontrados en las muestras de heces de unas 8.000 personas de 26 países de seis continentes.

Alrededor de 5.500 de esas personas habían sido diagnosticadas previamente con una de 11 enfermedades, incluido el cáncer colorrectal y la enfermedad inflamatoria intestinal enfermedad de Crohn. Las 2.500 personas restantes no tenían un diagnóstico de ninguna de las 11 afecciones. Después de entrenar la herramienta con estos datos, los investigadores probaron qué tan bien funcionaba en otras 1.140 muestras de heces de pacientes a los que se les diagnosticó enfermedades, como cáncer de páncreas y enfermedad de Parkinson, o no.

Los investigadores descubrieron que cuanto más alta es la puntuación GMWI2 de una persona, más se parece su microbioma intestinal al de alguien que no padece ninguna de estas enfermedades. Una puntuación más baja sugiere lo contrario: que su microbioma intestinal parece distinto del de un individuo con cualquiera de estas afecciones.

A diferencia de las herramientas de diagnóstico bien establecidas, como las colonoscopias para el cáncer colorrectal, GMWI2 no está diseñado para diagnosticar enfermedades específicas, enfatizaron los autores del estudio. Más bien, su objetivo es señalar cambios sutiles en la salud intestinal de una persona que pueden indicar que es probable que desarrolle una enfermedad determinada, escribieron.

En lugar de proporcionar diagnósticos, dijo Sung, la herramienta podría ser utilizada por personas que por lo demás están sanas pero que desean optimizar su salud intestinal para prevenir enfermedades, dijo. También puede ser útil para aquellos que tienen más probabilidades de desarrollar una enfermedad en particular porque es hereditaria, sugirió.

GMWI2 también podría usarse para evaluar qué tan bien se está recuperando el intestino de una persona después de haber recibido quimioterapia o antibióticos, ya que ambos tratamientos pueden dañar el microbioma, añadió. Estos cambios inducidos por el tratamiento pueden debilitar el sistema inmunológico, haciendo que los pacientes sean más vulnerables a futuras infecciones.

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No hay una solución única para todos

A pesar del atractivo potencial de una herramienta como GMWI2, los expertos dijeron a WordsSideKick.com que tienen algunas reservas sobre cómo podría usarse en la vida real.

El estudio es un "intento heroico" de vincular firmas específicas del microbioma intestinal con la salud o la enfermedad, afirmó Willem De Vos, profesor emérito de microbiómica humana en la Universidad de Helsinki que no participó en la investigación. . Sin embargo, "uno de los problemas de este enfoque es que la salud es difícil de definir: la salud es más que la ausencia de enfermedad", dijo de Vos a WordsSideKick.com en un correo electrónico.

Algunos científicos sostienen que no existe una definición universalmente aceptada de salud, porque la salud es una condición relativa. La salud para una persona no significa necesariamente lo mismo que para otra; por ejemplo, dos personas pueden obtener una puntuación GMWI2 de +6, pero la composición de su microbioma puede diferir completamente. Esto puede dificultar la definición de qué es un "microbioma saludable".

La salud de una persona también cambia a lo largo de su vida, por lo que cualquier puntuación de salud que se obtenga con una herramienta como GMWI2 perderá "sentido" a menos que se repita a lo largo del tiempo, afirmó el Dr. Fergus Shanahan, profesor y presidente del Departamento de Medicina de la University College Cork en Irlanda, que no participó en la investigación pero es un experto en el microbioma intestinal. La abundancia de ciertos microbios en el intestino también fluctúa diariamente y puede verse influenciada por la dieta, los niveles de estrés o el estado de ánimo de una persona.

Esto significa que una persona que intenta controlar la salud de su microbioma intestinal después de una ronda de antibióticos, por ejemplo, necesitaría seguir usando la herramienta de forma regular, como cada semana o mes, dijo Sung.

Además, es posible que sea necesario desarrollar varias versiones de GMWI2 para adaptar la herramienta a diferentes poblaciones, dijo Shanahan a WordsSideKick.com en un correo electrónico. "Varios estudios han demostrado que la composición del microbioma varía considerablemente en diferentes grupos étnicos, a veces de manera bastante marcada", afirmó. Esto puede deberse a diferentes factores sociales y ambientales, incluidos la dieta y el estilo de vida.

"Por lo tanto, cualquier herramienta para medir la salud de un individuo debe adaptarse a la población en la que vive", argumentó Shanahan.

Actualmente tampoco está claro qué haría la gente para alterar una puntuación GMWI2 "subóptima". En el artículo, Sung y sus colegas mencionan que podría incitar a las personas a hacerse más pruebas de diagnóstico o a modificar ciertos aspectos de su dieta o estilo de vida. Sin embargo, sin saber qué enfermedad tiene un paciente (si es que tiene alguna), puede resultar difícil implementar intervenciones específicas.

El equipo ahora está desarrollando la próxima versión de la herramienta, que se conocerá como Índice de bienestar del microbioma intestinal 3. (GMWI2 fue una actualización del prototipo más básico, el Índice de bienestar del microbioma intestinal, que se introdujo en 2020 y entrenado con un número mucho menor de muestras de heces).

Su objetivo es entrenar la próxima versión de la herramienta utilizando al menos 12.000 muestras de heces de una cohorte de personas mucho más diversa. También planean utilizar algoritmos de aprendizaje automático más sofisticados para interpretar los datos, dijo Sung. Suponiendo que obtengan la aprobación regulatoria, es posible que la herramienta pueda comercializarse en los próximos dos años, predijo.

Este artículo tiene únicamente fines informativos y no pretende ofrecer asesoramiento médico.

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